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                1. 蛋白質組學

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                  多組學推動的精準醫學

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                  2020-10-23 00:00:00
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                  詳細介紹:

                  青蓮百奧質譜平臺助力大連醫科大學附屬第1醫院孫忠偉老師于2019年7月31日在Biomedicine & Pharmacotherapy期刊上成功發表“Proteomic analysis of therapeutic effects of Qingyi pellet on rodent severe acute pancreatitis-associated lung injury.”一文,講述了中藥清胰顆粒治療嚙齒動物重癥急性胰腺炎相關性肺損傷過程中,有哪些蛋白發生明顯變化,進而對藥物發揮作用機制進行探討。

                  本文應用了TMT標記定量蛋白組學技術,具有定量準確、重復性好,實驗周期短等優勢,保質保量完成實驗的同時,又能縮短實驗周期,簡直就是快速發文的不二之選。接下來讓我們一起看一下孫忠偉老師的研究成果吧!


                  清胰顆粒治療嚙齒動物重癥急性胰腺炎相關性肺損傷的蛋白質組學分析


                  重癥急性胰腺炎(SAP)是臨床常見的以胰腺自身消化為特征的急腹癥。急性肺損傷作為SAP的主要并發癥之一,是造成高死亡率的主要原因。中藥清胰顆粒(QYT)在臨床上已被廣泛應用于重癥急性胰腺炎中。作者建立大鼠疾病模型,設置對照組與實驗組,TMT蛋白組學作為技術手段,意在闡明SAP-ALI潛在發病機制,寄望于開發新的治療靶點。
                  樣本選擇
                  CON group:3只健康SD大鼠的肺組織;
                  SAP group:3只重癥急性胰腺炎相關性肺損傷大鼠模型的肺組織;
                  QYT group:3只清胰顆粒治療肺損傷大鼠后的肺組織。
                  實驗設計


                  結果展示
                  QYT組蛋白表達情況與SAP組相反,與CON組相似(圖1)。蛋白組學數據顯示,共鑒定到25367個肽段和4723個可定量的蛋白質,其中1618個蛋白差異表達(圖2)。SAP組中有9種蛋白質表現出明顯的變化。在這9種蛋白中,有7種蛋白(α-2巨球蛋白,組織蛋白酶S,ras相關蛋白RAP-1A,整聯蛋白β,蛋白磷酸酶2A,細胞間粘附分子1和p38)上調,有2種蛋白(接頭蛋白Crk和胞漿磷蛋白)下調。QYT組的數據顯示接頭蛋白Crk和胞漿磷蛋白被上調,而其他7個蛋白被下調,Western blot和qPCR實驗結果再次驗證了上述結果的準確性(圖3-4)。

                  基因的京都百科全書顯示,這些蛋白在PI3K-AKT信號通路,趨化因子信號傳導途徑,細胞凋亡,白細胞跨內皮遷移和粘著斑中發揮作用。因此,QYT對SAP-ALI的治療機制可能是通過多組分的加和或協同相互作用(圖5)。

                  圖1:聚類熱圖



                  圖2:差異蛋白篩選




                  圖3:Western blot驗證LC-MS/MS數據結果




                  圖4:mRNA表達的統計分析




                  圖5:QYT治療作用的蛋白質組學分析示意圖

                  小結
                  本文首次報道組織蛋白酶S、蛋白磷酸酶2A和接頭蛋白Crk與SAP-ALI相關,可作為今后臨床防治SAP-ALI的靶點。TMT定量蛋白組學作為強有力的技術手段,為臨床新靶點的發現貢獻了一份力量。
                  參考文獻
                  Sun Z, Li L, et al. Proteomic analysis of therapeutic effects of Qingyi pellet on rodent severe acute pancreatitis-associated lung injury.Biomed. Pharmacother. 2019,118.(IF:3.743)



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