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          蛋白質組學

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          small RNA測序

          small RNA測序

          • 所屬分類:NGS技術服務
          • 瀏覽次數:
          • 發布日期:2021-08-10 15:53:04
          • 產品概述
          • 案例解析
          small RNA作為各類生物生命活動中重要的調控因子,其作用與功能被研究的較為透徹。small RNA們可參與基因的表達調控,轉錄后調控,RNA的加工與剪切,疾病發生發展及個體發育調控等重要的生物學過程。


          技術原理
          small RNA測序指對真核生物細胞內產生的,長度在18-30nt的RNA短序列進行的測序。small RNA具體可以分為微小RNA(miRNA),小干擾RNA(siRNA),以及PIWI蛋白結合的小RNA(piRNA)。這些不同類型的小RNA參與細胞生長、分化、個體發育、生殖等眾多生物學過程,因此對小RNA的測序可以定性、定量研究小RNA參與生物學過程的分子機制。

          蛋白質組學




          技術路線
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          注 測序策略:SE50;建議數據量:一般測序10M reads,深度測序20M reads 


          樣本要求
          總量 ≥ 2 μg,濃度 ≥ 50 ng/μL;
          OD260/280 ≥ 2.0
          RIN值:≧7.5(植物、真菌),≧8(動物)
          28S/18S≧1 (植物參考25S/18S ;原核參考23S/16S )特殊樣品只有18S可不參考 


          分析流程


          部分生信圖例

          每個樣本sRNA 所占比例的餅狀圖

          sRNA 長度分布

          成熟 miRNA 堿基分布

          樣本兩兩間 miRNA 的表達相關性

          服務后期

          樣本質檢合格后30個工作日


          相關文獻
          [1]Wu Jianguo,Yang Rongxin,Yang Zhirui,et ROS accumulation and antiviral defence control by microRNA528 in rice.[J]. Nature plants,2017,3.
          [2]Smit Kyra N,Chang Jiang,Derks Kasper,et. Aberrant MicroRNA Expression and Its Implications for Uveal Melanoma Metastasis.[J]. Cancers,2019,11(6).
          [3]Li Xiaodun,Kleeman Sam,Coburn Sally B,et. Selection and Application of Tissue microRNAs for Nonendoscopic Diagnosis of Barrett's Esophagus.[J]. Gastroenterology,2018,155(3).
          [4]Radtke A,Dieckmann K-P,Grobelny et. Expression of miRNA-371a-3p in seminal plasma and ejaculate is associated with sperm concentration.[J]. Andrology,2019,7(4).


          步驟雖繁 必不敢省人工

          試劑雖貴 必不敢減物力

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